A
在所有财务报表审计中，注册会计师应当了解内部控制（选项A正确，选项B错误）。注册会计师应当了解内部控制，无论是人工控制还是自动化控制（选项C错误）。如果与经营目标和合规目标相关的控制同注册会计师实施审计程序时评价或使用的数据相关，则这些控制也可能与审计相关（选项D错误）。